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lncRNA研究|lncRNA研究策略|lncRNA研究思路

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最后更新: 2017-07-18 16:19
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长链非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA)指的是长度超过200ntRNA分子。它们不编码蛋白,位于细胞核或胞质内,具有保守的二级结构,可与蛋白质、DNARNA相互作用,通过多种机制(如基因印记、染色质重塑、细胞周期调控、剪接调控、mRNA降解和翻译调控等)在多种层面上(如表观遗传学、转录调控及转录后调控等)调控基因的表达水平。

lncRNA参与多种生物学过程的调控,在多种生命活动中发挥重要作用,该领域的关注度也日益增高,已成为继信使RNA(mRNA)、小RNA(microRNAsiRNA)之后功能基因组学最火热的研究领域。
 

金开瑞现提供下述lncRNA研究服务:  

1、确定lncRNA表达

   利用RT-PCR或者qRT-PCR检测lncRNA在不同组织中的表达水平。

2、探究lncRNA特点

  1)通过QD-FISH原位杂交技术定位;或者通过细胞核质分离试剂盒得到RNAqRT-PCR检测其分布;

  2)全长序列试验方法:通过RACE得到lncRNA完整的全长序列。

3lncRNA的功能研究

LncRNA较长,承载的信息量多,更容易形成高级结构,其功能具有多样化和特异性强的特点。类似于miRNA,探讨lncRNA功能可用 gain/loss of function 策略,过表达或沉默lncRNA后观察表型。即研究lncRNA功能获得后或者功能缺失后对细胞增殖、凋亡、侵袭、转移与克隆形成,以及病毒的转录复制等的影响。

      1)功能获得性研究

构建lncRNA过表达质粒或者慢病毒、腺病毒包装载体。
      2)功能缺失性研究

siRNAshRNA、反义核酸。

4、检测结合蛋白质

利用体外转录,RNA pull down, MS等技术手段检测与RNA绑定的蛋白质。

5、预测并验证作用的miRNA

利用软件预测miRNAlncRNA的作用靶点,并进行验证。

6、表达调控

lncRNA表达与其他领域相结合,解释其调控机理。(1DNA甲基化和乙酰化:可通过检测相应基因甲基化、乙酰化差异与lncRNA结合分析。(2)转录因子:研究lncRNA与转录因子的调控机制。

 

如对lncRNA研究感兴趣或者需要技术支持,请您与我联系QQ3013422302 ,或者浏览我们公司的网站http://www.genecreate.cn/,可以搜索到您想要的服务信息,武汉金开瑞生物工程有限公司期待和您的合作。

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