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RNase R——RNase家族的“外貌协会成员”

放大字体  缩小字体 发布日期:2017-12-16  浏览次数:141
核心提示:RNA酶,是一种将RNA水解成小分子核苷酸的核酸酶。可简单分为外切核糖核酸酶和内切核糖核酸酶。其中外切酶包括PNPase,RNase PH,
 RNA酶,是一种将RNA水解成小分子核苷酸的核酸酶。可简单分为外切核糖核酸酶和内切核糖核酸酶。其中外切酶包括PNPase,RNase PH,RNase Ⅱ,RNase R,RNase D,RNase T,Oligoribonuclease,Exoribonuclease I,Exoribonuclease Ⅱ 等;内切酶包括RNase A,RNase H,RNase I,RNaseⅢ,RNase L,RNase P,RNase PhyM,RNase T1,RNase T2,RNase U2,RNase V1,RNase V 等。

在成员众多的RNase家族,就有这么一个“外貌协会”成员,它就是只针对线性RNA的RNase R。在介绍RNase R之前,先允许小达君给大家科普下环状RNA~~

 


图1. 线性RNA与环状RNA


环状RNA(Circular RNA,circRNA)是区别于线性RNA的一类新型环状非编码RNA,半衰期长,具有物种保守性和组织特异性。其独特的环状结构使其不容易被RNA酶降解,因此在细胞内稳定性很强,在新型生物标记、生物学机制研究等方向具有巨大的潜力和研究价值。

 


图2. 环状RNA的稳定性


“cicrRNA”这一概念最早出现在1971年,在RNA病毒中被发现,但长期以来,由于其表达丰度很低,所以一直被认为是转录的“噪音”,没有实际作用。

 


图3. 环状RNA的miRNA海绵作用


直到2012年,Salzman的一篇环状RNA文章为其正名,于是大量的研究者涌入这个领域,不断产出环状RNA的研究成果。目前研究最多的就是位于细胞质中的外显子形成的环状RNA,其含有大量miRNA结合位点,可起到miRNA海绵作用,结合并封闭miRNA的调控作用,从而使其靶基因表达增强。

 


图4. RNase R分离套索RNA


随着环状RNA的深入研究,环状RNA制备问题就越来越备受关注。Lucigen提供大肠杆菌来源的RNase R,是一种Mg依赖性的3’ →5’核糖核酸外切酶,能消化基本上所有线性RNA,但不消化套索或环状RNA的结构,或者3’突出短于7个核苷酸的双链RNA。即是除了tRNA,5S RNA和内含子套索结构外,大多数细胞RNA都将被RNase R完全消化。如图4,RNase R可从总RNA中分离出内含子前体mRNA剪切产生的套索RNA。以这种方法获得的RNA作为模板来生产标记的cDNA,可作为含有潜在的内含子序列的微阵列的目标,或者用于包含完整的染色体或者基因组的重叠区域平铺阵列。产生的cDNA不代表线性内含子,但其含有的序列是来源于内含子的。

 

应用

1.选择性剪切研究

2.基因表达研究

3.内含子cDNA制备

4.cDNA文库内含子筛选

5.剪切中间体和套索RNA分离

 

产品信息 

产品

名称

货号

规格

 

 

厂家

RNase R

RNR07250

250U

 

Lucigen(epicentre)


 
 
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